「義父の手作りの2階建てで」という意味が分からないので、応募を躊躇します。計画する建物は3階建てですよね？既存の2階建てを増築するということですか？それとも新しい設計で、義理のお父さんが大工さんとして3階建てを建てるということですか？

計画建物は特殊建築物の3階建てになるので、普通の木造は不可です。耐火建築物にする必要があります。特に作業所が絡むと何かと厄介です。2階建てを3階建てにするのでは、不可能です。3階を新築するとしても、普通の大工工事では建てられません。そのあたりを明確にしないと、簡単に応募できません。