建築家設計　木造新築、色々な箇所の寸法ズレについて。

田舎の自然豊かな森の中に建築家設計の17坪の小さな山荘を建てていてもうすぐ引渡し予定です。
建築会社は設計事務所が指定されたところにお願いしています。
また、私は遠方に住んでいるため現地にはなかなか行けず、現場監督や近所に住んでいる母が写真を撮ってくれてそれを確認しています。
完成が近づいてきて、キッチン調理台が完成した頃に写真を撮ってもらうとキッチン台を照らすスポットライトの位置や、調理台上の窓枠の位置が、設計図より少しズレている様な気がして測ってもらうと、スポットライトは設計より3.5cm奥に、窓は3〜4cm上についていることが発覚しました。
下がり天井で天井高いが低い上に、窓枠の上部は飾り棚板になっており、本来18.5cmほど高さがあったのですが窓が上にズレた分狭くなってしまいましたが修正は不可能とのことでした。

他にも浴室のダウンライト位置も3cmずれており、こちらはまだ下地の状態でしたので修正していただけることになりました。
キッチンの天井の上がロフトになっており、キッチンのライト位置を修正するには床を一旦剥がさないといけない様ですが、ここも渋々ですが直してもらえそうです。

他にもスイッチ位置が間違えていたり、引渡し1カ月前を切ってから色々と発覚して修正出来るところはしてもらっています。

気になっているのは、私が写真を見てでもわかる様なズレをこちらが指摘するまで現場の方も設計者も誰も気づかなかったのかと言う点と、3〜4cmのずれはそんなに頻繁に起こることなのかと言うことです。

他にもまだ不安な点はいくつかあるのですが、上記にお答え頂けると参考になります。
どうぞよろしくお願いいたします。