間取り、日当たりについて相談です。

回答させていただきます。

（2階に大きめのバルコニーができてしまうことになりました。）
広くて気持ちが良さそうなバルコニーですね。バルコニーに椅子やテーブルを置いたり、プランターで菜園をやるなど楽しめそうです。

（せっかくの吹き抜けなのに太陽の日はちゃんと入るのかが不安でGOできません）
図面では方位がわかりませんでした。もし上が北なら、２階の吹き抜け開口から十分な光が入るのではないでしょうか。また、夏の直射日光は強烈です。バルコニーの植栽で樹種を選んで上手に遮光すれば、むしろ吹き抜け１階から見上げた際に緑が見えて良いのではないかとも思いました。

以上感想です。

日は入ると思います。
ですが計画全体があまりよろしくないですね。
もっとも間取りは住む人が良ければそれで良いのですが。
もう一度冷静に細部を検討されるのも後悔が無くなって良いかも知れません。

アーバンギア 本多