再掲）町家の増築部分に二階を増築出来ますでしょうか。

以前の増築の確認申請は、工務店が申請されたのでしょうか？だったら、工務店に聞かれたらどうでしょうか？以前の工事で、完了検査を受けられましたか？普通、これでは検査を受けられないと思いますが。

写真に写っている基礎は、木造住宅の基礎ではありません。基礎の底版もありません。ホールダウン金物もありません。普通であれば、木造平屋でも申請に通りません。
ましてやこの基礎で2階建てなど、とても無理です。現状でも危ないのですよ！

町家耐震改修の補助金は、この部分には使えないはずです。あくまでも母屋の改修部分に使うものです。