一階を賃貸件事務所にした住宅を新築したいと考えています

現在中野区在住です。
夫婦二人で新築・中古を問わず家を探していました。
必須の希望としてルーフバルコニー・屋上があったため、物件が限られていることもあり家を建てていただくことを考えています。
こちらの事情や希望をあげた上で、質問に答えていただける方、相談にのっていただける方がいましたらうれしく思います。

【条件や希望】
屋上もしくは広いルーフバルコニーを希望
（屋上に関しては雨漏りの原因になりかねない等デメリットもよく話し合いました、それでも大事にメンテナンスして使用していきたく思います）
できれば一階と二階を別玄関にて分けたい
大学生の親類が1人いまして、その子が最低五年同居することとなっています。
その後も一緒に住み続ける可能性もありますし、退去することとなっても一階を事務所として賃貸できるように、お風呂は共用でもミニキッチンとお手洗いだけの6畳くらいの部屋を一階として、二階以上に私たち夫婦の居室、お手洗い、LDKを設けられたらと思っています。
具体的には一階賃貸部分の間取りは1K以上（風呂なし可、できればトイレとミニキッチンをつけたい）、二階以上は2SLDK以上であればよいと考えています。玄関も別にできればよりよいですが、こちらは必須の希望ではありません。
一階二階あわせて最低75㎡～くらいでよく、すごく広い住宅じゃなくても構わない

土地については西武新宿線中井～上石神井、駅徒歩15分以内。
もしくは中央線中野～武蔵境までですが、中央線は予算的に厳しいと思いますので西武新宿線をメインに考えています。用途地域は一種低層・中高などであればよいのですが近隣商業でも問題ありません。工業地域のみ不可です。

予算は土地と建物、仲介手数量・建築設計費などの諸経費すべて込みで4500～5200万円で考えています。できれば5000万円以下におさえたいとは思いますが、よほど良い条件がかさなれば5200を少し超えることも考えています。ただ、やはり希望は、予算の範囲内です。

わがままな条件ではありますが、予算をおさえての建築や長く暮らせる屋上住宅にご理解ある方、どうか相談にのっていただければ幸いです。
最後に、まったくの素人でして住宅購入決定後どのくらいの期間をへて家がたつのかわかりません。このような規模の住宅を建築する場合どのくらいの月日で建物が完成すると予想されるかも教えていただければ幸いです。